2013年3月14日，科技部發(fā)布了“關(guān)于開(kāi)展國家重大科學(xué)儀器設備開(kāi)發(fā)專(zhuān)項2013年度項目組織工作的函”，此函的發(fā)布也標志著(zhù)新一輪國家重大科學(xué)儀器設備開(kāi)發(fā)專(zhuān)項(以下簡(jiǎn)稱(chēng)為：重大儀器專(zhuān)項)的啟動(dòng)。重大儀器專(zhuān)項于2011年7月啟動(dòng)，在過(guò)去兩年中，共支持項目119項，國撥經(jīng)費達18億元。
　　相比于2012年度組織工作要求，2013年度重大儀器專(zhuān)項工作要求凸顯很多亮點(diǎn)和變化：
　　1、支持方向有了變化，并明確指出不予支持的儀器種類(lèi)。
　　工作要求中明確指出重點(diǎn)關(guān)注“科學(xué)儀器設備關(guān)鍵部件、科學(xué)儀器設備樣品前處理設備、高端電子顯微鏡、近紅外分析儀器、電子測量?jì)x器等重大科學(xué)儀器設備”，其中科學(xué)儀器設備關(guān)鍵部件、科學(xué)儀器設備樣品前處理設備、近紅外分析儀器是2013年度新增加的支持方向。此外，工作要求還指出“一般的儀器原理和方法研究，商業(yè)化前景不明確的儀器開(kāi)發(fā)工作，不屬于儀器專(zhuān)項范疇”，具體到儀器種類(lèi)，明確表明“臨床醫療儀器、生產(chǎn)設備、機械裝備以及平臺建設等，不屬于儀器專(zhuān)項的支持方向�！�
　　2、明確支持企業(yè)為項目承擔主體，提高對企業(yè)方的要求。
　　2013年度工作要求明確“支持有條件的企業(yè)牽頭承擔”。但對于企業(yè)牽頭或企業(yè)承擔產(chǎn)業(yè)化工作的企業(yè)又有嚴格要求，如企業(yè)需在中國大陸境內注冊、企業(yè)是高新技術(shù)企業(yè)或達同等條件、項目要與企業(yè)重點(diǎn)發(fā)展方向相符等。
　　此外，工作要求還指出“牽頭承擔項目的，企業(yè)投入的自籌研發(fā)經(jīng)費應不低于國撥經(jīng)費;非牽頭承擔項目，但承擔產(chǎn)業(yè)化工作的，企業(yè)投入的自籌研發(fā)經(jīng)費應不低于所獲得的國撥經(jīng)費。企業(yè)投入的自籌研發(fā)經(jīng)費應用于項目研發(fā)活動(dòng)，而不得用于生產(chǎn)線(xiàn)、廠(chǎng)房等產(chǎn)業(yè)化能力建設�！�
　　3、首次實(shí)施財政資助節點(diǎn)，力求保證支持項目的成功。
　　工作要求中新增探索財政資助節點(diǎn)改革措施，明確規定“針對企業(yè)牽頭項目，先立項，項目前半段主要由承擔單位自籌經(jīng)費實(shí)施，專(zhuān)項經(jīng)費資助10%;經(jīng)中期評估確認，有繼續開(kāi)發(fā)意義的，后半段再主要由專(zhuān)項經(jīng)費給予支持�！边@點(diǎn)應該是重大儀器專(zhuān)項實(shí)施以來(lái)最大的變化，強調風(fēng)險共擔。
　　4、明確項目涵蓋的內容，以及參與單位的職責。
　　工作要求中明確每個(gè)項目應包括“儀器開(kāi)發(fā)(含軟件開(kāi)發(fā))、應用開(kāi)發(fā)和工程化開(kāi)發(fā)等類(lèi)型工作，同時(shí)，還應提出項目產(chǎn)業(yè)化策劃方案”，并且要求“除儀器設備開(kāi)發(fā)單位外，產(chǎn)業(yè)化單位、應用單位也應從項目設計開(kāi)始，全程參與項目的組織和實(shí)施工作�！�
　　5、新增4個(gè)項目組織部門(mén)(地區)，并首次出現試點(diǎn)地區。
　　工作要求中新增中國航天科技集團公司、中國航天科工集團公司、中國船舶重工集團公司以及中國航空工業(yè)集團公司4個(gè)組織部門(mén)，并明確天津、浙江、四川、貴州以及陜西為5個(gè)試點(diǎn)地區。